Après avoir effectué des études d'architecture d'abord à l'ENSA Marseille puis à l'EPFL (2007-2014), Agathe Mignon a validé une thèse de doctorat sous la direction du professeur Dieter Dietz au sujet de la partcipation des usagers dans la conception architecturale de l'habitat collectif (2019). Enseignant depuis plusieurs années les bases de modélisation numérique aux étudiants en architecture, aisni que le dessin technique dans le cursus de mise à niveau EPFL, elle rejoint en 2023 le laboratoire IBOIS, occupée principalement par les questions liées à l'enseignement.