Constance Frei a soutenu en 2008 une thèse de doctorat (PhD) à l'Université de Genève sur l'articulation, l'ornementation et les différentes pratiques d'exécution dans la littérature pour violon en Italie au XVIIe siècle. En tant qu'assistante puis comme chargée de cours, elle a enseigné la musicologie à l'Université de Genève (2001-2011, 2015), à l'Université de Fribourg (2014-2016), au Collège des Humanités de l'EPFL (2014-2016) et aux Hautes Ecoles de Musique de Genève et Lausanne. Constance Frei a également étudié le piano et le violon au Conservatoire de Genève et a obtenu un diplôme de pédagogie à la Société Suisse de Pédagogie Musicale. Elle a collaboré à la réalisation de plusieurs éditions critiques publiées par Suvini Zerboni (Biagio Marini, Giovanni Battista Fontana, Girolamo Frescobaldi) et est régulièrement invitée à des conférences en Suisse, Allemagne, Espagne et Italie. En tant que violoniste, elle a donné des concerts en Italie, France et Allemagne. Elle a enregistré pour la maison discographique Tactus et a réalisé en tant que documentariste un film de 3 heures sur la technique violonistique en Italie au XVIIe siècle Plusieurs séjours de recherches en Italie (2005, 2010-2013) financés par le Fonds National de la Recherche Scientifique ont favorisé des collaborations à divers projets internationaux dans les domaines de la pratique instrumentale, de l'histoire de l'édition musicale, de la typographie musicale et des questions relatives à la notation, des relations entre éditeurs et compositeurs, de l'histoire du quatuor à cordes, de l'histoire de la transcription, recherches publiées sous forme d'articles et de livre. Le prix de la Fondation Pierre & Louisa Meylan lui a été décerné en 2015 pour l'ensemble de son parcours. Au mois d'août 2023, Constance Frei a été nommée Professeure associée à l'Université de Lausanne et enseigne également au Collège des Humanités de l'EPF Lausanne ainsi qu'à la Haute Ecole de Musique de Lausanne.