
Emmanuelle Rohrbach
Nationalité: Suisse
Expertise
PCR, dosage,electrophorèse
Séquençage Sanger (ABI 3130xl),
Préparation 16S Ribosomal RNA Gene Amplicons for the Illumina MiSeq System
Préparation de librairie Métagenomic, métatranscriptomic
Clonage
Extraction ARN/ADN (robot maxwell Promega, QIAcube, )
qPCR (Rotor Gene, MicPCR Bio Molecular Systems, Myra Robot, Magnetapure-96)
Ecotoxicologie
Maintien des élevages d’organismes pour la réalisation de tests écotoxicologiques sur le sol et les sédiments
Participation, appui technique à l'exécution d'analyses écotoxicologiques sur des échantillons de sol et de sédiments (y compris le développement de biomarqueurs moléculaires).
Participation, appui technique aux travaux d’échantillonnage sur le terrain
microbiologie
Fermentation
Biochimie (purification des protéines)
Formation des apprentis (avec certificat de maître d'apprentissage depuis 2006, expert au examen CFC en biologie)
Formation
Laborantine en biologie
| spécialité biologie moléculaire, Biochimie
1990 – 1993
Glaxo-Wellcome, Geneve
Dirigée par
Maitre d'apprentissage B.Allet
Diplome de Culture Generale
| option santé
1988 – 1990
Ecole Henry-Dunant Geneve
Dirigée par
Ecole secondaire
Expériences professionnelles
Technicienne R & D
Technicienne en Biologie
Biochimie : purification de protéines, purification d’anticorps, FPLC, test LPS, modification chimique de protéines (biotinylation), préparation d’échantillon à partir de gels 2D pour spectrométrie de masse.
Technicienne II
Biologie moléculaire : traduction in vitro, mini et maxi-prep, extraction du RNA au biophénol, clonage, sondes radioactives (P32), extraction de fragments.
Technicienne en Biologie
Responsable de l’organisation du laboratoire, gestion des commandes, maintenance des appareils, transmission des connaissances.
Culture de bactéries anaérobies (Sulfurospirillum, Dehalococoides), préparation de milieu classique et spécifique, microscopie, travail sous flux laminaire, marquage de bactéries par fluorescence (FISH, DAPI).
Technicienne de laboratoire
Publications représentatives
Reductive dechlorination of tetrachloroethene by a stepwise catalysis of different organohalide respiring bacteria and reductive dehalogenases
J. Maillard, M.-P. Charnay, C. Regeard, E. Rohrbach-Brandt, K. Rouzeau-Szynalski, P. Rossi and C. Holliger.
Published in in Biodegradation, vol. 22, num. 5, p. 949-960, 2011. in
Performance and microbial community composition dynamics of aerobic granular sludge from sequencing batch bubble column reactors operated at 20, 30, and 35
S. Ebrahimi, S. Gabus, E. Rohrbach-Brandt, M. Hosseini, P. Rossi, J. Maillard and C. Holliger
Published in in Applied Microbiology and Biotechnology, vol. 87, p. 1555-1568, 2010. in
Statistical assessment of the variability of the T-RFLP analysis applied to complex microbial communities.
P. Rossi, F. Gillet, E. Rohrbach and C. Holliger
Published in Applied and Environmental Microbiology, vol. 75, num. 22, p. 7268-7270, 2009. in 2009
TAP binds to the constitutive transport element (CTE) through a novel NA-binding motif that is sufficient to promote CTE-dependent RNA export from the nucleus
I. C. Braun, E. Rohrbach, C. Schmitt, Elisa Izaurralde.
Published in EMBO J . 1999 Apr 1;18(7):1953-65. doi: 10.1093/emboj/18.7.1953. in 1999
A bacterial signal peptide directs efficient secretion of Eucaryotic proteins in the Baculovirus
B. Allet, A. R. Bernard, A. Hochmann, E. Brandt- Rohrbach, p. Graber, E. Magnenat, G. Mazzei, L. Bernasconi
Published in Protein Expression and Purification 9, 61-68 (1997) in 1997
Environment rather than breed or body site shapes the skin bacterial community of healthy sheep as revealed by metabarcoding
S. M. Jost; L. Cardona; E. Rohrbach; A. Mathis; C. Holliger
Published in Veterinary Dermatology. 2023. DOI : 10.1111/vde.13223. in 2023
Seasonal and spatial variability of antibiotic resistance genes and Class I integrons in the rivers of the Mekong delta, Vietnam
Thi Thu Hang Pham, Khoa Dinh Hoang Dang, Emmanuelle Rohrbach, Florian Breider, Pierre Rossi
Published in https://doi.org/10.1101/2021.11.25.469999 in 2021
Temporal evolution of bacterial communities associated with the in-situ wetland-based remediation of a marine shore porphyry copper tailings deposit.
N. Diaby, B. Dold, E. Rohrbach, C. Holliger and P. Rossi
Published in Science of the Total Environment, vol. 533, p. 110–121, 2015. in 2015
Use of silicate minerals for long-term pH control during reductive dechlorination of high tetrachloroethene concentrations in continuous flow-through columns
E. Lacroix, A. Brovelli, J. Maillard, E. Rohrbach-Brandt, D. A. Barry and C. Holliger
Published in Science of the Total Environment, vol. 482-483, p. 23-35, 2014. in 2014
Diversity of cobalamin riboswitches in the corrinoid-producing organohalide respirer Desulfitobacterium hafniense.
P. K. Choudhary, A. Duret, E. Rohrbach-Brandt, C. Holliger, R. K. O. Sigel and J. Maillard
Published in Journal of bacteriology, vol. 195 (22), p. 5186-5195, 2013. in 2013
An unusual tandem-domain rhodanese harbouring two active sites identified in Desulfitobacterium hafniense
L. Prat, J. Maillard, E. Rohrbach-Brandt and C. Holliger
Published in Febs Journal, vol. 279, p. 2754-2767, 2012. in 2012