Régis Vivien
Domaines de compétences
Systématique classique (oligochètes aquatiques)
Ecologie aquatique
Systématique moléculaire
Ecotoxicologie des sédiments
Ecologie aquatique
Systématique moléculaire
Ecotoxicologie des sédiments
Mission
Réalisation de projets de recherche dans les domaines de la systématique, écologie et écotoxicologie:- Application, validation et développement de méthodes biologiques basées sur l’étude des communautés d’oligochètes pour l'évaluation de la qualité des sédiments des cours d'eau et des lacs (sédiment fins/sableux ; sédiments grossiers/milieu hyporhéique)
- Développement d’indices oligochètes basés sur l'identification des espèces à l’aide de code-barres génétiques (séquençage à haut débit de spécimens marqués génétiquement, DNA metabarcoding)
- Création d’une base de données de référence de code-barres génétiques des espèces d’oligochètes aquatiques (spécimens collectés en Suisse)
- Etablissement de seuils d’effets in situ de polluants dans les sédiments (métaux, PCB, PAH et pesticides) sur la base de l’étude des communautés d’oligochètes
- Développement d’un indice chironomidés génétique pour les lacs (séquençage à haut débit de spécimens marqués génétiquement)
- Description/redescription d’espèces d’oligochètes, inventaire des oligochètes aquatiques en Suisse (sédiments de surface, milieu hyporhéique, eaux souterraines)
Formation
Licence en biologie
-
Université de Genève
2000-2004
Master universitaire en sciences naturelles de l'environnement
-
Université de Genève
2006-2009
Publications
Autres publications
Publications choisies
Vivien R. & Ferrari B.J.D. (2025) New data on the use of oligochaete communities for assessing the impacts of wastewater treatment plant effluents on receiving streams. Water, 17, 724.Vivien, R., & Martin, P. (2025) Maintaining taxonomic accuracy in genetic databases: a duty for taxonomists—Reanalysis of the DNA sequences from Mercan et al. (2024) on the genus Potamothrix (Annelida, Clitellata) in Turkish lakes. Zootaxa, 557, 555-562.
Vivien, R., Casado, M.C., Höss, S., Haegerbaeumer, A., Traunspurger, W., Pesce, S., Ferrari, B.J.D. (2024) Use of nematode and oligochaete communities for assessing the effects of toxic pollutants in lake sediments – An exploratory study in Lake Geneva. Bulletin de la Société Vaudoise des Sciences Naturelles, 103, 39-59.
Vivien, R., Lafont, M., Issartel, C., Ferrari, B.J.D., Martin, P. (2024) The genus Chaetogaster Baer, 1827 (Annelida, Clitellata) in Switzerland: A first step towards cataloguing its molecular diversity and description of new species on a DNA sequence basis. Biology, 13, 693.
Vivien, R., Cermakova, K., Pawlowski, J., Ferrari, B.J.D. (2023) OligoGen : Développement de méthodes oligochètes génétiques pour évaluer la qualité biologique des sédiments de cours d’eau. Centre suisse d'écotoxicologie appliquée Eawag-EPFL, Lausanne, Suisse
Martin, P., Knüsel, M., Alther, R., Altermatt, F., Ferrari, B., Vivien, R. (2023) Haplotaxis gordioides (Hartmann in Oken, 1819) (Annelida, Clitellata) as a sub-cosmopolitan species: a commonly held view challenged by DNA barcoding. Zoosymposia, 23, 78-93.
Tixier, G., Rochfort, Q., Grapentine, L., Marsalek, J., Lafont, M., Vivien, R. (2023) Toxicity of sediments in eight urban stormwater management ponds: bioassessment by oligochaete community metrics used in the sediment quality triad. Water Science & Technology, 87, 1112.
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Pesce, S., et al. (2019) Recommandations d’un collectif franco-suisse d’experts pour une meilleure évaluation de la qualité écotoxicologique des sédiments par l’étude des communautés benthiques. Sciences Eaux & Territoires, 55, 2-9.
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Lefrançois, E., Apothéloz-Perret-Gentil, L., Blancher, P., Botreau, S., Chardon, C., Crepin, L., Cordier, T., Cordonier, A., Domaizon, I., Ferrari, B.J.D., Guéguen, J., Hustache, J.-C., Jacas, L., Jacquet, S., Lacroix, S., Mazenq, A.-L., Pawlowska, A., Perney, P., Pawlowski, J., Rimet, F., Rubin, J.-F., Trevisan, D., Vivien, R., Bouchez, A. (2018) Development and implementation of eco-genomic tools for aquatic ecosystem biomonitoring: the SYNAQUA French-Swiss program. Environmental Science and Pollution Research, 25, 33858-33866.
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Vivien, R., Wyler, S., Lafont, M., Pawlowski, J. (2015) Molecular barcoding of aquatic oligochaetes: implications for biomonitoring, PLoS ONE, 10, e0125485.
Vivien, R., Tixier, G., Lafont, M. (2014) Use of oligochaete communities for assessing the quality of sediments in watercourses of the Geneva area and Artois-Picardie basin (France): proposition of heavy metal toxicity thresholds. Ecohydrology & Hydrobiology, 14, 142-151.
Vivien, R. (2013) Note sur la diversité des oligochètes aquatiques dans la région genevoise (Suisse). Revue suisse de Zoologie, 120, 415-420.
Vivien, R., Lafont, M. (2013) Diversité des oligochètes aquatiques dans la région genevoise (Suisse). Revue suisse de Zoologie, 120, 161-173.
Vivien, R. (2012) Cinclidotus P. Beauv. (Cinclidotaceae, Bryophyta) dans les cours d’eau du canton de Genève : répartition et écologie. Saussurea, 42, 127-143.
Vivien, R., Lafont, M., Perfetta, J. (2011) Proposition d’un seuil de toxicité des métaux lourds des sédiments mis en évidence par les vers oligochètes dans quelques cours d’eau. Bulletin de la Société Vaudoise des Sciences Naturelles, 92, 153-164.